L'établissement principal du SHOM (EPSHOM), situé à Brest,
possède au sein du 
Centre Militaire d'Océanographie,
deux services implantés à Toulouse,

• le BRESM (Bureau de Recherche et d'Etudes SHOM/Météo)
• la CELENV (CELlule d'ENVironnement de la marine)